Хмара тегів в seo, чи впливає це на просування сайту?

- впливає, якщо хмара тегів відкрито для індексації. Так як створює Переспа тексту, і дублі сторінок.

І через нього можна заробити АГС, (потрапити під фільтр).

Хмара тегів має сенс для блогу чи новинного сайту. Для сайту компанії воно нафіг не потрібно і виглядає як спам. І якщо він знаходитися внизу, куди не кожен користувач добереться, то він теж там не потрібен.

Коштував чи робити собі на сайті хмара тегів?

- не варто, краще видалити (якщо є). Якщо не хочете його видаляти, закрийте в noindex і nofollow.